OverC®, Burning Rock Dx'in ELSA-seq teknoloji platformu üzerine kurulu çoklu kanser erken tespit testidir. Kandaki hücre dışı DNA (cfDNA) üzerindeki 70.000'den fazla metilasyon bölgesini yeni nesil dizileme ile tarar. Bu makalede teknolojiyi ve analitik çerçeveyi özetliyoruz.
ELSA-seq Platformu
- Tek zincirli kütüphane oluşturma: cfDNA'dan son derece düşük miktarlarda (minimum 0,5 ng) kararlı sekanslama kütüphaneleri üretilir.
- Tek baz çözünürlük: metilasyon durumu, ilgili bölgelerde tek baz hassasiyetiyle profil çıkarılır.
- Yayın: teknoloji, Nature Biomedical Engineering'de yayımlanmıştır (Liang N ve ark., 2021).
Metilasyon Tabanlı Tespitin Mantığı
Kanser hücreleri, sağlıklı hücrelere kıyasla farklı ve doku özgüllüğü taşıyan metilasyon işaretleri bırakır. Bu işaretler erken evrede ortaya çıkar, güçlü sinyal üretir ve kanser dokusunun kökenini izlemeye olanak tanır. OverC®, altı kanser türüyle (akciğer, yemek borusu, kolorektal, karaciğer, pankreas, yumurtalık) ilişkili bu bölgeleri kapsamlı biçimde tarar.
BRMERMAID® Algoritması ve Skorlama
- Makine öğrenimi tabanlı BRMERMAID® algoritması, tek moleküllü mutasyon modellerini tanır ve bilgi tabanlı çoklu gürültü azaltma uygular.
- Hesaplanan kanser sinyali kapsamlı skoru 0,5 ve üzerindeyse sonuç "Kanserle İlişkili Metilasyon Sinyalleri: Tespit Edildi"; altındaysa "Tespit Edilmedi" olarak değerlendirilir.
- Sinyal saptandığında köken organ tahmini üretilir.
Analitik Kalite Çerçevesi
- Analiz 16 kalite kontrol adımıyla izlenir; örnek tabanlı QC parametreleri arasında DNA konsantrasyonu (≥0,33 ng/µL), metilasyon sinyal yoğunluğu (≥350) ve sinyal saflığı bulunur.
- Laboratuvar akreditasyonları: CAP (Amerikan Patologlar Koleji), CLIA (ABD klinik laboratuvar akreditasyonu) ve Guangdong Klinik Laboratuvar Merkezi "Yüksek Verimlilikte Dizileme Laboratuvarı" sertifikası.
- İthal test tüpleri kullanılır; numune oda sıcaklığında laboratuvara iletilir.
Kaynakça
- Liang N, ve ark. Nat Biomed Eng. 2021 Haz;5(6):586-599 (ELSA-seq teknolojisi).
- Burning Rock Dx OverC® ürün dokümanları (brbiotech.com).
Rx-only — Reçeteye bağlı tarama testidir. Galleri® bir tanı testi değildir. Pozitif sonuç kanser tanısı anlamına gelmez; negatif sonuç kanseri dışlamaz. Test, hekiminizin önerdiği düzenli kanser taramalarının yerine geçmez. Galleri® tüm kanser türlerini tespit etmez.